Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms