Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms