Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms