Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rmi2Q3UPE3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rmi2Q3UPE3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms