Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms