Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms