Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms