Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms