Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam117bQ3U3E2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms