Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms