Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms