Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms