Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc102aQ3TMW1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms