Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms