Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms