Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms