Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cers3Q1A3B0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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