Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms