Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms