Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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Ttc39dQ0VF76 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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