Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms