Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms