Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms