Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NeblQ0II04 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms