Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms