Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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