Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms