Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ebf1Q07802 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms