Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MestQ07646 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MestQ07646 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MestQ07646 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MestQ07646 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MestQ07646 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MestQ07646 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MestQ07646 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MestQ07646 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MestQ07646 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MestQ07646 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MestQ07646 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MestQ07646 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MestQ07646 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MestQ07646 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms