Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms