Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs3Q05895 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms