Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a1Q05722 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms