Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms