Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms