Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms