Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms