Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabpaQ00422 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms