Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp9bP98195 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp9bP98195 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms