Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms