Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
rp9P97762 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
rp9P97762 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
rp9P97762 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
rp9P97762 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
rp9P97762 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
rp9P97762 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
rp9P97762 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms