Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms