Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bop1P97452 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bop1P97452 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bop1P97452 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bop1P97452 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bop1P97452 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bop1P97452 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bop1P97452 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bop1P97452 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms