Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1aP97357 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1aP97357 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1aP97357 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1aP97357 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf1aP97357 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1aP97357 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1aP97357 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1aP97357 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1aP97357 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1aP97357 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1aP97357 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1aP97357 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1aP97357 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1aP97357 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1aP97357 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1aP97357 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1aP97357 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1aP97357 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1aP97357 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1aP97357 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1aP97357 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms