Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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