Protein–RNA interactions for Protein: P83882

Rpl36a, 60S ribosomal protein L36a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36aP83882 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl36aP83882 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms