Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms