Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ncoa1P70365 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa1P70365 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms