Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms