Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms