Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfixP70257 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfixP70257 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
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NfixP70257 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
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NfixP70257 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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NfixP70257 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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NfixP70257 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfixP70257 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfixP70257 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfixP70257 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfixP70257 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms